Dle diagnózy a povahy dodaného vzorku zahrnuje bakteriologické vyšetření kultivaci aerobní, mikroaerofilní a anaerobní, event.přímou mikroskopii.
Na základě kultivačního nálezu provádíme identifikaci kmenů a stanovení citlivosti na antibiotika a antimykotika.
Doba odezvy může být v ojedinělých případech prodloužena (např.rozizolováním směsných kultur, technické závady, údržba přístrojů…).